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Le CEPF est une initiative conjointe de l'Agence Française de Développement, Conservation International, l'Union européenne, le Global Environment Facility, le Gouvernement du Japon et La Banque Mondiale.
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Cartographier les forêts restantes des Comores pour étudier les moteurs de la déforestation et les alternatives possibles à la culture et à l'extraction de l'ylang-ylang, une huile essentielle qui est un élément clé de l'économie locale ; et définir des plans de conservation pour deux espèces menacées importantes qui dépendent de ces forêts, la chauve-souris frugivore de Livingstone (Pteropus livingstonii) et le lémurien mangouste (Eulemur mongoz).
Direction stratégique: 2 Permettre à la société civile d'intégrer la biodiversité et la conservation dans la prise de décision politique et économique.